Для интрауретральных аппликаций используются различные препараты, такие как алпростадил. Из уретры препарат всасывается и с кровотоком попадает в кавернозные тела, где происходят реакции, вызывающие эрекцию. Данный метод схож с предыдущим, но позволяет исключить инъекцию в половой член.
В настоящее время эта терапия не получила широкого распространения из-за дороговизны препаратов и побочных реакций (чувство жжения в уретре), а также необходимости обязательного использования презерватива.